作者:ZinFingerNase 来源:生物谷 2012-9-8 15:34:53
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Tag Archives: 测序
[文献]Tools for mapping high-throughput sequencing data
引言:因为没有权限,我没有看到全文。从作者给的官网链接内容来看,作者对各种工具的特性进行了一个详细的比较,详情参看http://wwwdev.ebi.ac.uk/fg/hts_mappers/。……【阅读全文】
[文献]Exome sequencing and complex disease: practical aspects of rare variant association studies
Do, R., Kathiresan, S., Abecasis, G. R. (2012). Exome sequencing and complex disease: practical aspects of rare variant association studies. Human molecular genetics, (734), 137. doi:10.1093/hmg/dds387. http://hmg.oxfordjournals.org/content/21/R1/R1.full……【阅读全文】
[荐]Short Course 2010 Documentation
NGS Catalog
NGS Catalog: A Database of Next Generation Sequencing Studies in Humans……【阅读全文】
[荐]一些实用的生信程序和脚本
University of Alberta的Stothard Research Group主页上有一些很好的生物信息学程序和脚本,如:……【阅读全文】
[转]便携基因组测序仪
信息来源:与Siri面对面,最新十款新奇产品!……【阅读全文】
[PAPER]RNA-seq analysis protocol
Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks.
Nature Protocols 7, 562–578 (2012) doi:10.1038/nprot.2012.016 Published online 01 March 2012……【阅读全文】
[荐]Pipeline Workflows from CCB
[转载]RPKM简介
转载自: RPKM简介 | Zyb Blog
RNA-seq是透过次世代定序的技术来侦测基因表现量的方法,在衡量基因表现量时,若是单纯以map到的read数来计算基因的表现量,在统计上是一件相当不合理事,因为在随机抽样的情况下,序列较长的基因被抽到的机率本来就会比序列短的基因较高,如此一来,序列长的基因永远会被认为表现量较高,而错估基因真正的表现量,所以Ali Mortazavi等人在2008年提出以RPKM在估计基因的表现量。……【阅读全文】