3月 09

Time For Science: UNIX tools and other lab tools

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Time For Science是一套工具包，主要包括两部分内容：（通过Perl实现的）增强型的Unix系统工具，以及常用生物信息学工具的汇总。除此以外，还有一些Unix的配置文件、绘图的R脚本等。

下面简单介绍其中的几个小工具（详细介绍请点击文末的工具介绍链接）：

  • trash.pl

类似于rm，但比rm更安全：它会把文件删除至默认的回收站中，而不是直接删除。

  • tree_of_filestructure.sh

显示目录树，完美支持中文！（不过好像只会现实到最底层的目录，而不会显示最低层目录下的文件。）

  • cut.pl

增强型的cut：可以在输出中对列进行重排。
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3月 08

实用的SHELL脚本

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  • 实际问题

假设有成百上千个GEO数据文件，每个文件中都有好多行的基因表达数据，文件的第一列是NCBI geneid。现在想从这许多GSE中提取出每个geneid的基因表达量，即根据geneid来对原始数据进行分组。如何实现呢？下面是使用shell的一种解决办法。……【阅读全文】

3月 07

LAMP兄弟连Linux视频教程

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  • 讲师

李明，LAMP兄弟连技术总监、CSDN特聘讲师、HRBAR人力资源学院讲师，火龙果软件技术顾问、中农大网院特聘讲师，计算机行业十年从业经验，历任即时科研集团研究院副院长、PHPChina 技术总监、金蝶软件项目经理等职。曾获微软认证讲师、中国UNIX用户协会讲师、即时科研集团金牌讲师。主持编写出版《完美应用Ubuntu》《UNIX系统管理实用教程》《Solaris8系统管理员指南》等多本计算机图书。……【阅读全文】

3月 04

【推荐】R的IDE/GUI

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RStudio™ is a new integrated development environment (IDE) for R. RStudio combines an intuitive user interface with powerful coding tools to help you get the most out of R.
RStudio brings together everything you need to be productive with R in a single, customizable environment. Its intuitive interface and powerful coding tools help you get work done faster.
RStudio is available for all major platforms including Windows, Mac OS X, and Linux.……【阅读全文】