2月
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Tag Archives: FASTQ
2月
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测序质量分析统计工具
2月
17
FASTQ2FASTA方法汇总
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使用Bioperl
详细参看“FASTQ格式转换为FASTA格式”……【阅读全文】
2月
14
FASTQ格式不同质量的互转
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代码
eb02e99bb32288c43cde19333dbf832f001……【阅读全文】
2月
14
FASTQ格式转换为FASTA格式
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代码
eb02e99bb32288c43cde19333dbf832f002……【阅读全文】
2月
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FASTQ格式中的测序质量
Fastq格式中的测序质量有两种:一种是标准的Sanger质量(即:Phred质量值),另一种则是Solexa/Illumina的变体。详细解释与描述请参考文末的扩展阅读。……【阅读全文】
2月
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FASTQ格式
Fastq格式是用来保存第二代测序数据的格式,其中同时包含了测序序列与测序质量,而且序列本身和测序质量都以单个的ASCII字符来表示。Fastq没有标准的后缀名,一般使用“.fq”或者“.fastq”,当然,“.txt”亦可。
Fastq格式一般包含四行:第一行以“@”起始,后跟相应的描述信息(类似于Fasta格式);第二行是序列本身;第三行由“+”起始,后面的描述信息可有可无,若有的话,则与第一行中的完全一样;第四行是第二行测序序列的测序质量,字符数与第二行相等。
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