Tag Archives: 格式

11月 28

[荐]瑞士军刀级的格式转换软件：FF Multi Converter

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FF Multi Converter 支持丰富的音视频、文档、图片格式间的转换，是当前格式转换方面的“瑞士军刀”，支持简体中文界面。以 FFMPEG 作为后端处理音视频格式转换，unoconv 进行文档处理，PythonMagick 库进行图像文件转换，在手动编译时需要安装这三个软件包。……【阅读全文】

5月 15

【转载】初品Bioperl

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序：让程序读起来更生动
第一篇：让BioPerl在你的电脑上安家
第二篇：构造一条fasta序列
第三篇：从本地文件中获取fasta序列
第四篇：从本地文件中获取Genbank序列
第五篇：序列格式的转换
第六篇：从远程数据库下载序列之一
第六篇：从远程数据库下载序列之二
第七篇：对象的类型……【阅读全文】

2月 13

FASTQ格式

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Fastq格式是用来保存第二代测序数据的格式，其中同时包含了测序序列与测序质量，而且序列本身和测序质量都以单个的ASCII字符来表示。Fastq没有标准的后缀名，一般使用“.fq”或者“.fastq”，当然，“.txt”亦可。

Fastq格式一般包含四行：第一行以“@”起始，后跟相应的描述信息（类似于Fasta格式）；第二行是序列本身；第三行由“+”起始，后面的描述信息可有可无，若有的话，则与第一行中的完全一样；第四行是第二行测序序列的测序质量，字符数与第二行相等。
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