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报告正文
近日,科学顾问团(Science Advisory Board)公布了其最近对下一代测序(NGS)技术的调查报告,以补充之前对于实时定量PCR和微阵列等基因组技术的综合性研究。……【阅读全文】
近日,科学顾问团(Science Advisory Board)公布了其最近对下一代测序(NGS)技术的调查报告,以补充之前对于实时定量PCR和微阵列等基因组技术的综合性研究。……【阅读全文】
Briefings in Bioinformatics (Volume 14 Issue 2 March 2013), Special Issue: Next Generation Sequencing Visualization:……【阅读全文】
在线教程(Fall 2012 – Analyzing High Throughput Sequencing Data):http://www.personal.psu.edu/iua1/pages/fall-2012-bmmb-597D.html
在线视频(新一代测序技术数据分析[英语]):http://www.youku.com/playlist_show/id_17418799_ascending_1_mode_pic_page_1.html……【阅读全文】
引言:因为没有权限,我没有看到全文。从作者给的官网链接内容来看,作者对各种工具的特性进行了一个详细的比较,详情参看http://wwwdev.ebi.ac.uk/fg/hts_mappers/。……【阅读全文】
Do, R., Kathiresan, S., Abecasis, G. R. (2012). Exome sequencing and complex disease: practical aspects of rare variant association studies. Human molecular genetics, (734), 137. doi:10.1093/hmg/dds387. http://hmg.oxfordjournals.org/content/21/R1/R1.full……【阅读全文】
注:说是“生物信息学培训”,其实就是我在实验室内部的Journal Club上做的入门级别的生物信息学介绍。……【阅读全文】
RNA-seq是透过次世代定序的技术来侦测基因表现量的方法,在衡量基因表现量时,若是单纯以map到的read数来计算基因的表现量,在统计上是一件相当不合理事,因为在随机抽样的情况下,序列较长的基因被抽到的机率本来就会比序列短的基因较高,如此一来,序列长的基因永远会被认为表现量较高,而错估基因真正的表现量,所以Ali Mortazavi等人在2008年提出以RPKM在估计基因的表现量。……【阅读全文】
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