关于seqTools v1.0的详细信息可以参看：对FASTA格式的简单处理与统计
关于seqTools v2.0的详细信息可以参看：[更新]seqTools v2.0……【阅读全文】
2月
27
Tag Archives: 序列
11月
03
[更新]seqTools v2.0
关于seqTools v1.0的详细信息可以参看：对FASTA格式的简单处理与统计……【阅读全文】
6月
01
对FASTA格式的简单处理与统计
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缘起
模仿lh3开发的网页版工具SeqTools
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功能
1.格式化FASTA文件。
2.反向互补FASTA序列。
3.获取FASTA序列的长度。
4.计算GC含量并对ATGC计数。
5.搜索模式（子序列、motif等）。
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5月
26
使用R绘制简单的序列图
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资料来源
《Building Bioinformatics Solutions with Perl, R and MySQL》（P162-163）……【阅读全文】
5月
15
【转载】初品Bioperl
5月
14
获取基因组的子序列
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下载基因组的序列，将此问题转换为“从Fasta文件中提取子序列”。【适用于单个或批量】
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使用UCSC的galaxy【适用于单个或批量】
第一步：整理基因组坐标格式。
把基因组坐标整理为如下格式，保存到一个纯文本文件中。……【阅读全文】
4月
08
获取反向互补序列并计算GC含量
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程序代码
222e96a85315dc7252c04f137c7a71ba005……【阅读全文】
4月
07
产生简单随机DNA序列的Perl脚本
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程序源码
222e96a85315dc7252c04f137c7a71ba007……【阅读全文】
