注：说是“生物信息学培训”，其实就是我在实验室内部的Journal Club上做的入门级别的生物信息学介绍。……【阅读全文】
11月
03
Category Archives: 所有博文
11月
01
[转载]RPKM简介
转载自: RPKM简介 | Zyb Blog
RNA-seq是透过次世代定序的技术来侦测基因表现量的方法，在衡量基因表现量时，若是单纯以map到的read数来计算基因的表现量，在统计上是一件相当不合理事，因为在随机抽样的情况下，序列较长的基因被抽到的机率本来就会比序列短的基因较高，如此一来，序列长的基因永远会被认为表现量较高，而错估基因真正的表现量，所以Ali Mortazavi等人在2008年提出以RPKM在估计基因的表现量。……【阅读全文】
10月
29
刻舟求剑
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史书记载：《吕氏春秋·察今》
楚人有涉江者，其剑自舟中坠于水，遽契其舟曰：“是吾剑之所从坠也。”舟止，从其所契者入水求之。舟已行矣，而剑不行，求剑若此，不亦惑乎？……【阅读全文】
10月
29
掩耳盗铃
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史书记载：《吕氏春秋·自知》
范氏之亡也，百姓有得钟者，欲负而走，则钟大不可负；以锤毁之，钟况然有声。恐人闻之而夺己也，遽掩其耳。恶人闻之，可也；恶己自闻之，悖也！……【阅读全文】
10月
29
Beamer中需要使用fragile的环境
在Beamer中使用verbatim, verb, listings包（插入程序源代码）时，需要使用fragile参数。此外，还有一些需要注意的地方，可以参看：Beamer fragile frames。……【阅读全文】
10月
28
托管在Google Code上的自己的代码仓库
yixf-codes
把自己写的一些比较有用的程序和收集的比较有意思的程序多放到Google Code上了，感兴趣的可以去看看有没有自己需要的程序。……【阅读全文】
10月
27
Gmail没有退出按钮的解决办法
因为种种原因，在Gmail中你可能找不到“退出”按钮。可以通过以下方法解决：……【阅读全文】
10月
26
Vim的插件管理工具
使用Vim，不可避免要安装这样那样的插件。插件多了，就需要有个工具来管理它们。据我查找，Vim的插件管理工具至少有以下几个：……【阅读全文】
10月
25
使用lftp批量下载 轻松克隆数据库
如果想下载整个数据库到本地服务器上，可以使用基于命令行的lftp，利用其提供的-f选项。……【阅读全文】
10月
25
Ubuntu11.10中的Compiz设置
经过近两天的折腾，终于把Ubuntu系统从10.10换到11.10了！在此过程中主要遇到两个问题：不会使用Unity和Compiz的异常崩溃。前者主要是使用习惯问题，经过一两天的摸索，已经基本顺手了；后者则原因多多，非一言两语可以说清。为了避免各位朋友重蹈覆辙，此处推荐一篇资料：Ubuntu 11.10 Linux 3D 桌面完全教程，显卡驱动安装方法，compiz特效介绍，常见问题解答。……【阅读全文】
