基因组工具套件——EMBOSS

EMBOSS 是”The European Molecular Biology Open Software Suite”的缩写,是一个开放源代码的序列分析软件包,它是一组为分子生物学家所设计的公开且免费软件。该软件能够自动识别处理以不同格式存储的数据, 甚至可以通过互联网提取数据,此外同软件包一同提供的还包括大量的程序库,软件包整合了 100多个的序列分析程序,可以满足一般实验室的各种各样的序列分析要求。并且,因为该软件包同时提供了一个扩展库,它也是允许其他科学家依据自由软件精神编制、发布软件的一个平台。EMBOSS 同时将现在可以得到的一系列序列分析工具整合成一个无缝的整体。EMBOSS遵照GPL协议,打破了向商业软件包发展的传统模式。

使用者可以通过三种不同的方式使用 EMBOSS 软件:第一种是通过命令行的方式;第二种是通过 X-Windows 的方式使用 EMBOSS 软件的图形界面;第三种是内联网的方式。使用者可以免费获得这些软件以及相关界面程序。

EMBOSS is “The European Molecular Biology Open Software Suite”. EMBOSS is a free Open Source software analysis package specially developed for the needs of the molecular biology (e.g. EMBnet) user community. The software automatically copes with data in a variety of formats and even allows transparent retrieval of sequence data from the web. Also, as extensive libraries are provided with the package, it is a platform to allow other scientists to develop and release software in true open source spirit. EMBOSS also integrates a range of currently available packages and tools for sequence analysis into a seamless whole. EMBOSS breaks the historical trend towards commercial software packages.

官网资源:
EMBOSS
Jemboss
EMBOSS explorer
Web interfaces

其他资源:
EMBOSS: high-quality FREE Open Source software for sequence analysis
EMBOSS 工具使用总结