本人设计的针对本科生的生物信息学实验课程设计,包括涉及EMBOSS和Galaxy的三个题目:
- 基于 EMBOSS 平台对 *** 基因进行序列分析
- 基于 Galaxy 平台分析 *** 物种基因在基因组中的分布
- 基于 Galaxy 平台分析 *** 物种 SNP 在不同特征区域中的分布
对于每一个题目,我都记录了详细的操作步骤,对于想学习EMBOSS和Galaxy(主要是后者)的朋友可能会有所帮助。
PS:考虑到大部分学生以后很有可能不会继续做生物信息,所以我设计题目的主要目的是——希望学生能够了解并掌握易用、强大的EMBOSS工具套件和Galaxy平台,这样以后遇到数据处理的问题时,就可以自己使用这些工具予以解决,而不用求助于专业的生物信息工作者了。
扩展阅读
基因组工具套件——EMBOSS
生物信息学培训资料