人类单个个体SNP、InDel等的密度

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参考阅读：人类基因组中的基因密度、特征长度和SNP密度

 

ClassAutosomesChromosomeX
Length[bp]2881033286155270560
SNP(Number)3600000105000
SNP(Density)[/kb]1.250.68
InDel(Number)34400013000
InDel(Density)[/10kb]1.190.84
Large Deletion(Number)71726
Large Deletion(Density)[/Mb]0.250.17

 

PS1：人类基因组使用的是hg19，数据下载自UCSC Table。
PS2：基因组不包括chr*_*。
PS3：SNP、InDel的数目数据来在于千人基因组计划。（Table1）
PS4：千人基因组计划的文章：An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes, Nature  491, 56–65 (01 November 2012) doi:10.1038/nature11632